【課題】生体高分子を含む系の動力学的な挙動を予測するシミュレーションにおいて、計算精度を向上させかつ計算時間を短縮することを可能とする。
【解決手段】シミュレーション装置１０において、質点系の構造を記述する質点座標ｘに基づいて、中継座標Ｒ_Ｓおよび非中継座標Ｒ_Ｆを設定する座標設定手段１６と、非中継座標Ｒ_Ｆを中継座標Ｒ_Ｓに従属させることにより非中継座標の構成Ｒ_Ｆ（Ｒ_Ｓ）を求め、中継座標Ｒ_Ｓの変化に伴う非中継座標Ｒ_Ｆの変化が中継座標Ｒ_Ｓに与える影響を考慮しながら、集団座標ｑ^†の関数としての中継座標の構成Ｒ_Ｓ（ｑ^†）を求める座標抽出手段１８と、運動方程式の解として得られる集団座標ｑ^†（ｔ）、中継座標の上記構成Ｒ_Ｓ（ｑ^†）および非中継座標の上記構成Ｒ_Ｆ（Ｒ_Ｓ）に基づいて、質点座標ｘの時間発展を予測する逆変換手段２０とを備える。 （もっと読む）

【課題】ＨＩＶ−１標的配列を増幅・検出するために有用である、オリゴヌクレオチドプライマーセット、プローブ、及び前記したプライマーセットとプローブの組合せを提供する。
【解決手段】ＣＲＦ及び群間組換え体を含めたＨＩＶ−１群Ｍ、Ｎ及びＯ株をすべて、特に、ＨＩＶ−１変異体を、核酸増幅方法に従って、特異的且つ高感度で検出するために使用され得るプライマーセット。更に、前記各種プライマーセットと組合せて、ＨＩＶ−１標的配列を増幅・検出するために使用され得る、プローブオリゴヌクレオチド。 （もっと読む）

【課題】メチル化ＤＮＡを検出するための生体外検出方法の提供。
【解決手段】以下のステップ：（ａ）メチル化ＤＮＡに結合することができるポリペプチドで、容器をコーティングし；（ｂ）前記ポリペプチドを、メチル化ＤＮＡ、及び／又は非メチル化ＤＮＡを含むサンプルと接触させ；そして（ｃ）前記ポリペプチドのメチル化ＤＮＡへの結合を検出する、を含む、メチル化ＤＮＡを検出するための生体外検出方法。 （もっと読む）

【課題】 高価な手段を用いて流体の保持位置を補正する必要のない、流路を有する流体デバイスを用いて熱処理を行う装置、および該デバイス内での流体の移動を制限する方法を提供する。
【解決手段】 少なくとも一の流路を有する流体デバイス（４）を用いて熱処理を行う装置であって、前記流路の一部を温度変化させる第一の温度変化手段（１）と、前記第一の温度変化手段による前記流路内の流体の膨張または収縮を前記流路の他の一部の流体の収縮または膨張で緩衝させるための第二の温度変化手段（２）と、を有する。 （もっと読む）

【課題】化学反応および／または生体反応に関する測定を行う情報システムおよび方法を提供する。
【解決手段】化学反応および／または生体反応の最初に存在する分析物の量を測定するための方法およびシステム、ならびに増幅反応の数学的もしくは図式的解析を含む解析の一部を自動化するためのコンピュータ実行による方法およびシステム。
【効果】変動し得る閾値やＣｔ値を計算する必要なく、試験サンプル中に存在する標的の量を客観的に定量することが可能となる。さらに、Ｃｔ後のサイクルでのデータなどの以前は無視されていたデータなどのＰＣＲ増幅曲線の形状を解析することで、反応における阻害程度を求める上で利用可能な情報を用いることができる。 （もっと読む）

【課題】ＡＬＳの患者において、ＶＥＧＦ ＨＲＥまたはコーディング配列の変異は確認されておらず、循環ＶＥＧＦレベルの低さの有意性は依然として測定されていない。
【解決手段】本発明は、神経細胞損傷もしくは神経細胞死、または軸索変性、特に筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）などの神経変性疾患によって特徴付けられる疾患または状態を治療するための使用、またはその断片もしくは変種に関する。本発明はまた、神経変性疾患表現型、特にＡＬＳ表現型に関連したヒトアンジオゲニン遺伝子における複数の変異について記載する。個体が神経損傷もしくは神経細胞死、または軸索変性によって特徴付けられる疾患または状態に罹患したかどうか、または発症することが遺伝的に予測されるかどうかを評価する方法もまた記載する。 （もっと読む）

【課題】より簡便にメチル化DNA試料を得ることができるチル化DNAの検出方法を提供することを課題とする。
【解決手段】メチル化DNAを含む可能性のある試料と、メチル化DNAと結合できるタンパク質とを接触させて、前記試料中のメチル化DNAと前記タンパク質とを結合させる工程と、前記結合工程で得られた試料と、少なくとも１種類のデオキシリボヌクレアーゼとを接触させて、前記試料中のDNAを分解する工程と、前記分解工程で得られた試料における、前記タンパク質との結合により前記デオキシリボヌクレアーゼで分解されなかったメチル化DNAを検出する工程とを含み、前記デオキシリボヌクレアーゼの少なくとも１種類が、一本鎖DNAを分解できるメチル化感受性制限酵素とは異なるデオキシリボヌクレアーゼである、試料中のメチル化DNAを検出する方法により、上記課題を解決する。 （もっと読む）

【課題】ハイブリダイゼーション用途において、レポータフルオロフォアを、レポータ／クエンチャ対に使用する際に、望ましくない特性、分離が困難な混合物、正電荷、合成の困難、オリゴヌクレオチド合成中の不安定性、又は、他の望ましいレポータとの発光波長のオーバラップ等の問題を解決する、オリゴヌクレオチドプローブ用の試薬を提供する。
【解決手段】フルオロフォア部分が約（３００）〜約（８００）ｎｍの範囲の発光波長を有し、及び／又は、クエンチャが置換４−（フェニルジアゼニル）フェニルアミン構造を有するオリゴヌクレオチド−フルオロフォア−クエンチャ接合体。 （もっと読む）

【課題】グラム陰性細菌、特に、髄膜炎菌に対する血清殺菌活性(SBA)アッセイを提供する。
【解決手段】SBAアッセイは、髄膜炎菌に対する血清抗体の機能的活性を測定するための最も重要な方法である。被験体または集団が侵襲的髄膜炎菌に対して血清反応陽性であるかどうかを決定するためには、SBA試験は理想的には感度がよく、かつ特異的であるべきである。標準的な髄膜炎菌血清型AおよびWのSBAを、この点において大幅に改善することができる。 （もっと読む）

【課題】網膜色素変性原因遺伝子ＥＹＳの新規遺伝子変異であるｃ．４９５７＿４９５８ＩｎｓＡ変異を検出するためのプライマー、プローブ、マイクロアレイ、及び、これらを備える検出キット、並びに、ＲＰ原因遺伝子変異の検査方法、ＲＰへの遺伝的感受性の検査方法を提供する。
【解決手段】ＥＹＳ遺伝子におけるｃ．４９５７＿４９５８ＩｎｓＡ変異を検出することができるプライマー、プローブ、及び、マイクロアレイを用いることにより、網膜色素変性症患者から採取されたＤＮＡ含有試料において、ＥＹＳ遺伝子におけるｃ．４９５７＿４９５８ＩｎｓＡ変異の有無を検査する。 （もっと読む）

【課題】血液などの臨床関連試料のための高度に感度のよい、ハイスループット免疫増幅アッセイを提供する。
【解決手段】このアッセイは、オリゴヌクレオチドに複合体形成している分析物特異的結合成分を含む２つの近接構成要素の使用を含む。分析物を結合させることにより、近接構成要素のオリゴヌクレオチド部はアンプリコンを形成するのに十分に近くなる。次いで、アンプリコンの増幅および増幅した核酸の検出により、分析物の存在を検出する。本発明のアッセイの感度は、分析物と複合体化しない近接構成要素により誤ったまたは非特異的アンプリコンの形成を妨げることによって向上している。一実施形態では、互いにハイブリッド形成しないオリゴヌクレオチド部に結合するハイブリッド形成ブロッカーオリゴヌクレオチドを使用することにより、標的非依存性アンプリコンの形成を妨げる。捕捉された複合体が放出されるまでアンプリコンの形成を妨げる固相捕捉オリゴヌクレオチドを提供することにより、バックグラウンドはさらに減少している。 （もっと読む）

【課題】サトウキビの量的形質の中でも一茎重に関連するマーカーを提供する。
【解決手段】サトウキビの染色体特定の塩基配列により挟まれる領域から選ばれる連続する核酸領域からなる、サトウキビの一茎重関連マーカー。 （もっと読む）

【課題】新規人工塩基対に基づく核酸、ならびに当該核酸の調製方法、利用を提供する。
【解決手段】置換された若しくは無置換の２−ホルミル−１Ｈ−ピロール−１−イル基を塩基として有するヌクレオチドと、６位置換された９Ｈ−プリン−９−イル基を塩基として有するヌクレオチドとが形成する塩基対。置換された若しくは無置換の２−ホルミル−１Ｈ−ピロール−１−イル基を塩基として有するヌクレオチドを含む核酸を鋳型として転写、逆転写又は複製を行い、前記置換された若しくは無置換の２−ホルミル−１Ｈ−ピロール−１−イル基を有するヌクレオチドの相補的な位置に、６位置換された９Ｈ−プリン−９−イル基を有するヌクレオチドを組み込む、ことを含む、核酸の調製方法。 （もっと読む）

【課題】癌を早期に発見するための診断方法や治療方法等の評価に適する、遺伝子異常の検出に基づいた哺乳動物由来の検体の癌化度評価方法を提供すること。
【解決手段】本発明は、哺乳動物由来の検体の癌化度を評価する方法であって、
（１）哺乳動物由来の検体に含まれるFibrillin 2遺伝子のメチル化頻度又はそれに相関関係がある指標値を測定する第一工程、及び
（２）測定された前記メチル化頻度又はそれに相関関係がある指標値と、対照とを比較することにより得られる差異に基づき前記検体の癌化度を判定する第二工程
を有することを特徴とする評価方法
等に関する。 （もっと読む）

【課題】ウミホタル系生物発光測定を行う際のバックグラウンドを低下し、Ｓ／Ｎ比を改善する。
【解決手段】本発明は、ウミホタルルシフェリンとアスコルビン酸またはその塩、エリソルビン酸またはその塩、亜硫酸水素塩、亜硫酸塩からなる群から選ばれる１種又は２種以上を含む、ウミホタルルシフェラーゼとウミホタルルシフェリンを用いた生物発光系に使用するためのウミホタルルシフェリン安定化組成物。 （もっと読む）

【課題】微小流体素子（２０５）から選択された１つ以上の蛍光指標を撮像する装置を提供すること。
【解決手段】本装置は少なくとも１つの微小流体素子（２０５）内の少なくとも１つのチャンバに連結された撮像パスを含む。上記撮像パスは、上記少なくとも１つの微小流体素子（２０５）内の上記少なくとも１つのチャンバ内の１つ以上のサンプルからの１つ以上の蛍光発光信号の送信を準備する。上記チャンバは、上記撮像パスの法線の実空間寸法によって特徴付けられるチャンバサイズを有する。本装置はまた、上記撮像パスに連結された光学レンズシステム（２１０、２１２）を含む。この光学レンズシステムは、上記チャンバに関連付けられた上記１つ以上の蛍光信号を送信するよう構成されている。 （もっと読む）

【課題】サトウキビ植物の量的形質の中でも葉長に関連するマーカーを提供する。
【解決手段】サトウキビの染色体における特定の塩基配列により挟まれる領域から選ばれる連続する核酸領域からなる、サトウキビ葉長関連マーカー。少なくとも一方の親がサトウキビ植物である後代植物の染色体を抽出する工程と、上記で得られた染色体における上記サトウキビ葉長関連マーカーの存在・非存在を測定する工程とを含む、葉長が増大したサトウキビ系統を識別する方法。 （もっと読む）

【課題】核酸のＰＣＲ増幅産物、該ＰＣＲ増幅産物の制限酵素断片、核酸の制限酵素断片等の標的核酸の分離検出を、短時間かつ高い分離性能で行うことができるイオン交換クロマトグラフィー用充填剤、及びこの充填剤を用いるイオン交換クロマトグラフィーによる標的核酸の分離検出方法を提供する
【解決手段】基材微粒子の表面に強カチオン性基と弱アニオン性基とを有する、イオン交換クロマトグラフィー用充填剤。 （もっと読む）

【課題】核酸分離用担体が充填されたマイクロ流路において、標的とする核酸鎖を効率良く分離するための技術を提供すること。
【解決手段】多孔質担体表面に導入されたスルホン基と、標的核酸鎖に相補的な塩基配列を有する捕捉鎖のアミノ基とが、スルホンアミド結合により固相化した核酸分離用担体。 （もっと読む）

【課題】簡便、迅速かつ正確なオーチャードグラスの品種識別に有用なＳＳＲプライマー対、マーカー遺伝子、及び品種識別方法を提供する。
【解決手段】オーチャードグラスのゲノム上のＳＳＲ領域の両側の塩基配列を用いて設計したプライマー対、該プライマー対を利用してＰＣＲ増幅した増幅産物からなる特定マーカー遺伝子、及び識別対象となるオーチャードグラスのバルクＤＮＡを使用することで、個体間の遺伝子のばらつきを無くし、品種特異的なＳＳＲをＰＣＲで特異的に増幅させ、増幅された特定マーカー遺伝子断片の長さの違いを検出することで、品種の識別を行う、オーチャードグラス１４品種の品種識別方法。 （もっと読む）