東京都銘柄豚トウキョウＸの判別のためのＤＮＡマーカー、およびその利用
【課題】 東京都銘柄豚トウキョウXの判別のためのDNAマーカーの提供、並びに、当該DNAマーカーを用いたトウキョウXの判別法の提供を課題とする。
【解決手段】
本発明者はトウキョウXの維持豚全頭で対立遺伝子が固定し、かつ、一般豚や黒豚では多型性の高いマーカー（多型マーカー）を104個開発することに成功した。さらに、本発明によって開発した多型マーカーを用いて、実際に98％程度の高い判別率でトウキョウXを判別することに成功し、本発明を完成させた。本発明の多型マーカーを用いることにより、簡便かつ効率的にトウキョウXの判別を行うことが可能である。
【解決手段】
本発明者はトウキョウXの維持豚全頭で対立遺伝子が固定し、かつ、一般豚や黒豚では多型性の高いマーカー（多型マーカー）を104個開発することに成功した。さらに、本発明によって開発した多型マーカーを用いて、実際に98％程度の高い判別率でトウキョウXを判別することに成功し、本発明を完成させた。本発明の多型マーカーを用いることにより、簡便かつ効率的にトウキョウXの判別を行うことが可能である。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
東京都銘柄豚トウキョウXの判別方法であって、ブタゲノム中に存在する下記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の一もしくは複数の多型マーカーを用いて、下記（Ｂ）の工程によって判別する方法。
（Ａ）
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
（Ｂ）上記（Ａ）のそれぞれの多型マーカーにおけるトウキョウXに固定された対立遺伝子の塩基種、および該対立遺伝子の頻度が記載された下記表１〜３に基づき、トウキョウXを判別する工程
[表１]
[表２]
[表３]
【請求項２】
ブタゲノム中に存在する前記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の多型マーカーを含むDNA領域を増幅し、その増幅産物の多型を検出する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
多型の検出を、増幅産物を制限酵素で処理することによって行う、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
東京都銘柄豚トウキョウXの判別方法であって、ブタゲノム中に存在する下記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の一もしくは複数の多型マーカーを用いて、下記（Ｂ）の工程によって判別する方法。
（Ａ）
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
（Ｂ）上記（Ａ）のそれぞれの多型マーカーにおける塩基種が下記表４〜６の場合に、トウキョウXではないと判別する方法。
[表４]
[表５]
[表６]
【請求項５】
以下の（ａ）または（ｂ）のいずれかのオリゴヌクレオチドを有効成分とする、トウキョウX判別用検査薬。
（ａ）配列番号：１〜１０４のいずれかに記載の塩基配列もしくはその相補鎖にストリンジェント条件下でハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであって、該塩基配列中に存在する下記（１）〜（１０４）のいずれかの多型部位を含む領域を増幅するためのＰＣＲプライマー用オリゴヌクレオチド。
（ｂ）配列番号：１〜１０４のいずれかに記載の塩基配列もしくはその相補鎖にストリンジェント条件下でハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであって、該塩基配列中に存在する下記（１）〜（１０４）のいずれかの多型部位を含むDNA領域とハイブリダイズすることを特徴とするプローブ用オリゴヌクレオチド。
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
【請求項６】
下記（１）〜（１０４）のいずれかに記載の遺伝マーカー。
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、31位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、271位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、193位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、238位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、318位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、35位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、194位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、495位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、81位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、133位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、63位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、232位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、354位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、102位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、248位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、405位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、123位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、245位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、269位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、361位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、65位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、158位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、118位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、315位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、436位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、37位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、205位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、491位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、490位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、100位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、440位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、85位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、121位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、108位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、140位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、51位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、96位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、342位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、522位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、523位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、101位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、145位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、326位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、510位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、545位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、278位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、480位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、378位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、222位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、213位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、250位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、409位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、327位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、337位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、426位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、78位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、226位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、449位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、217位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、312位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、405位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、279位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、174位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、198位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、51位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、491位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、454位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、176位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、334位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、44位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、147位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、252位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、255位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、60位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、555位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、79位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、345位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、220位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、322位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、320位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、81位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、479位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、390位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、477位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、53位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、108位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、455位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、249位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、435位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、85位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、462位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、109位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、122位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、161位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、254位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、263位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、243位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、272位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、257位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、78位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、173位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
【請求項１】
東京都銘柄豚トウキョウXの判別方法であって、ブタゲノム中に存在する下記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の一もしくは複数の多型マーカーを用いて、下記（Ｂ）の工程によって判別する方法。
（Ａ）
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
（Ｂ）上記（Ａ）のそれぞれの多型マーカーにおけるトウキョウXに固定された対立遺伝子の塩基種、および該対立遺伝子の頻度が記載された下記表１〜３に基づき、トウキョウXを判別する工程
[表１]
[表２]
[表３]
【請求項２】
ブタゲノム中に存在する前記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の多型マーカーを含むDNA領域を増幅し、その増幅産物の多型を検出する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
多型の検出を、増幅産物を制限酵素で処理することによって行う、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
東京都銘柄豚トウキョウXの判別方法であって、ブタゲノム中に存在する下記（Ａ）の（１）〜（１０４）のいずれかに記載の一もしくは複数の多型マーカーを用いて、下記（Ｂ）の工程によって判別する方法。
（Ａ）
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
（Ｂ）上記（Ａ）のそれぞれの多型マーカーにおける塩基種が下記表４〜６の場合に、トウキョウXではないと判別する方法。
[表４]
[表５]
[表６]
【請求項５】
以下の（ａ）または（ｂ）のいずれかのオリゴヌクレオチドを有効成分とする、トウキョウX判別用検査薬。
（ａ）配列番号：１〜１０４のいずれかに記載の塩基配列もしくはその相補鎖にストリンジェント条件下でハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであって、該塩基配列中に存在する下記（１）〜（１０４）のいずれかの多型部位を含む領域を増幅するためのＰＣＲプライマー用オリゴヌクレオチド。
（ｂ）配列番号：１〜１０４のいずれかに記載の塩基配列もしくはその相補鎖にストリンジェント条件下でハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであって、該塩基配列中に存在する下記（１）〜（１０４）のいずれかの多型部位を含むDNA領域とハイブリダイズすることを特徴とするプローブ用オリゴヌクレオチド。
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の31位
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の271位
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の193位
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の238位
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の318位
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の35位
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の194位
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の495位
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の81位
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の133位
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の63位
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の232位
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の354位
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の102位
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の248位
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の405位
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の123位
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の245位
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の269位
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の361位
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の65位
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の158位
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の118位
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の315位
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の436位
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の37位
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の205位
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の491位
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の490位
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の38位
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の100位
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の440位
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の85位
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の121位
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の108位
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の140位
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の51位
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の96位
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の342位
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の522位
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の523位
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の101位
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の145位
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の326位
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の510位
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の545位
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の278位
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の480位
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の378位
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の222位
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の213位
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の250位
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の409位
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の327位
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の337位
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の426位
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の78位
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の226位
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の449位
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の217位
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の312位
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の405位
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の279位
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の174位
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の198位
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の51位
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の491位
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の454位
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の38位
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の176位
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の334位
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の44位
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の147位
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の252位
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の255位
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の60位
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の555位
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の79位
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の345位
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の220位
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の322位
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の320位
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の81位
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の479位
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の390位
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の477位
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の53位
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の108位
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の455位
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の249位
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の435位
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の38位
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の85位
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の462位
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の109位
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の122位
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の161位
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の254位
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の263位
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の243位
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の272位
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の257位
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の78位
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の173位
【請求項６】
下記（１）〜（１０４）のいずれかに記載の遺伝マーカー。
（１）配列番号：１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、31位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２）配列番号：２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、271位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（３）配列番号：３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、193位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（４）配列番号：４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、238位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５）配列番号：５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、318位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６）配列番号：６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、35位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（７）配列番号：７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、194位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（８）配列番号：８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、495位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（９）配列番号：９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、81位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０）配列番号：１０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、133位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１１）配列番号：１１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、63位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１２）配列番号：１２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、232位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１３）配列番号：１３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、354位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１４）配列番号：１４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、102位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１５）配列番号：１５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、248位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１６）配列番号：１６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、405位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１７）配列番号：１７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、123位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１８）配列番号：１８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、245位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１９）配列番号：１９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、269位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２０）配列番号：２０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、361位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２１）配列番号：２１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、65位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２２）配列番号：２２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、158位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２３）配列番号：２３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、118位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２４）配列番号：２４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、315位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（２５）配列番号：２５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、436位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（２６）配列番号：２６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、37位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２７）配列番号：２７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、205位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２８）配列番号：２８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、491位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（２９）配列番号：２９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、490位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３０）配列番号：３０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３１）配列番号：３１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、100位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３２）配列番号：３２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、440位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３３）配列番号：３３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、85位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３４）配列番号：３４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、121位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３５）配列番号：３５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、108位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３６）配列番号：３６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、140位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（３７）配列番号：３７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、51位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（３８）配列番号：３８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、96位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（３９）配列番号：３９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、342位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４０）配列番号：４０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、522位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４１）配列番号：４１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、523位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（４２）配列番号：４２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、101位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４３）配列番号：４３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、145位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４４）配列番号：４４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、326位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（４５）配列番号：４５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、510位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（４６）配列番号：４６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、545位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４７）配列番号：４７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、278位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（４８）配列番号：４８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、480位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（４９）配列番号：４９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、378位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５０）配列番号：５０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、222位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５１）配列番号：５１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、213位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５２）配列番号：５２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、250位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５３）配列番号：５３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、409位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５４）配列番号：５４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、327位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５５）配列番号：５５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、337位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５６）配列番号：５６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、426位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（５７）配列番号：５７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、78位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（５８）配列番号：５８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、226位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（５９）配列番号：５９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、449位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６０）配列番号：６０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、217位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６１）配列番号：６１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、312位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６２）配列番号：６２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、405位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６３）配列番号：６３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、279位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（６４）配列番号：６４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、174位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（６５）配列番号：６５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、198位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（６６）配列番号：６６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、51位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（６７）配列番号：６７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、491位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（６８）配列番号：６８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、454位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（６９）配列番号：６９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７０）配列番号：７０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、176位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７１）配列番号：７１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、334位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７２）配列番号：７２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、44位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７３）配列番号：７３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、147位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（７４）配列番号：７４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、252位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（７５）配列番号：７５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、255位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７６）配列番号：７６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、60位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（７７）配列番号：７７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、555位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７８）配列番号：７８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、79位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（７９）配列番号：７９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、345位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８０）配列番号：８０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、220位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８１）配列番号：８１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、322位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（８２）配列番号：８２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、320位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（８３）配列番号：８３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、81位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８４）配列番号：８４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、479位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８５）配列番号：８５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、390位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８６）配列番号：８６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、477位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がAであることを特徴とする遺伝マーカー
（８７）配列番号：８７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、53位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（８８）配列番号：８８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、108位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（８９）配列番号：８９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、455位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（９０）配列番号：９０に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、249位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９１）配列番号：９１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、435位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９２）配列番号：９２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、38位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９３）配列番号：９３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、85位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９４）配列番号：９４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、462位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（９５）配列番号：９５に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、109位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９６）配列番号：９６に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、122位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９７）配列番号：９７に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、161位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（９８）配列番号：９８に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、254位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（９９）配列番号：９９に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、263位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１００）配列番号：１００に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、243位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がCであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０１）配列番号：１０１に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、272位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がTであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０２）配列番号：１０２に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、257位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０３）配列番号：１０３に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、78位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
（１０４）配列番号：１０４に記載の塩基配列の全部もしくは部分配列からなる遺伝マーカーであって、173位の多型部位を含み、かつ該多型部位の塩基種がGであることを特徴とする遺伝マーカー
【図１】
【公開番号】特開２０１１−７８３４５（Ｐ２０１１−７８３４５Ａ）
【公開日】平成２３年４月２１日（２０１１．４．２１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−２３２７１２（Ｐ２００９−２３２７１２）
【出願日】平成２１年１０月６日（２００９．１０．６）
【国等の委託研究の成果に係る記載事項】（出願人による申告）農林水産省「食品・農産物の表示の信頼性確保と機能性解析のための基盤技術の開発」（畜産物のＤＮＡ判別技術開発）、「アグリ・ゲノム研究の総合的な推進」（動物ゲノム情報を活用した新需要創造のための研究）委託事業、産業技術力強化法第１９条の適用を受ける特許出願
【出願人】（５９３０２７５８７）社団法人農林水産先端技術産業振興センター (7)
【出願人】（５０１１６７６４４）独立行政法人農業生物資源研究所 (200)
【出願人】（５０６０１５０８５）公益財団法人東京都農林水産振興財団 (4)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２３年４月２１日（２０１１．４．２１）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年１０月６日（２００９．１０．６）
【国等の委託研究の成果に係る記載事項】（出願人による申告）農林水産省「食品・農産物の表示の信頼性確保と機能性解析のための基盤技術の開発」（畜産物のＤＮＡ判別技術開発）、「アグリ・ゲノム研究の総合的な推進」（動物ゲノム情報を活用した新需要創造のための研究）委託事業、産業技術力強化法第１９条の適用を受ける特許出願
【出願人】（５９３０２７５８７）社団法人農林水産先端技術産業振興センター (7)
【出願人】（５０１１６７６４４）独立行政法人農業生物資源研究所 (200)
【出願人】（５０６０１５０８５）公益財団法人東京都農林水産振興財団 (4)
【Ｆターム（参考）】
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