非天然のアミノ酸およびポリペプチドを含んでいる組成物、これらが関連する方法、ならびにこれらの利用
本明細書において、非天然アミノ酸、少なくとも1つの非天然アミノ酸を含んでいるポリペプチド、このような非天然のアミノ酸およびポリペプチドを作製するための方法が開示される。非天然アミノ酸はそれ自体またはポリペプチドの一部である場合に、種々の官能基を含んでいてもよいが、一般的に少なくとも1つのインドール基、カルボニル基および/またはヒドラジン基を有している。また本明細書において、さらに翻訳後修飾された非天然アミノ酸のポリペプチド、このような修飾をするための方法、このようなポリペプチドを精製するための方法が開示される。修飾された非天然アミノ酸のポリペプチドは、少なくとも1つのインドール基、カルボニル基および/またはヒドラジン基を含んでいる。さらに、このような非天然アミノ酸のポリペプチドおよび修飾された非天然アミノ酸のポリペプチドを、治療、診断、および他のバイオテクノロジーなどへ使用するための方法が開示される。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
下記の化合物1〜4の構造を有し:
【化1】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は、必要に応じてシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、または−C(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤;少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され;
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する化合物、またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグ、もしくは溶媒和物。
【請求項2】
上記Aは、結合、置換もしくは非置換の低級アルキレン、またはフェニレン、ピリジニレン、ピリミジニレンおよびチオフェニレンから成る群より選択される非置換もしくは置換のアリーレンである、請求項1に記載の化合物。
【請求項3】
上記Aは結合である、請求項2に記載の化合物。
【請求項4】
上記Bは、結合、低級アルキレン、置換低級アルキレン、−O−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−CON(R’’)−、−NR’−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−N(R’’)CO−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−CON(R’’)−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−S(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−S(O)(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、または−S(O)2(アルキレンもしくは置換アルキレン)−である、請求項1に記載の化合物。
【請求項5】
上記Bは結合である、請求項5に記載の化合物。
【請求項6】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項7】
上記R2は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項8】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項7に記載の化合物。
【請求項9】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項10】
上記Xは、蛍光性部分、燐光性部分、化学発光性部分、キレート化部分、電子密度の高い部分、磁性部分、インターカレートする部分、放射性部分、発色性部分、およびエネルギーを伝達する部分から成る群より選択される検出可能な標識である、請求項1に記載の化合物。
【請求項11】
上記Xは水溶性ポリマーである、請求項1に記載の化合物。
【請求項12】
上記水溶性ポリマーは、ポリアルキレンオキシドまたは置換ポリアルキレンオキシドを含んでいる、請求項11に記載の化合物。
【請求項13】
上記水溶性ポリマーは、−[(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−(水素、アルキルまたは置換アルキル)]xを含んでおり、xは20〜10,000である、請求項11に記載の化合物。
【請求項14】
上記水溶性ポリマーは、約2KDa〜約40KDaの分子量を有するm−PEGである、請求項11に記載の化合物。
【請求項15】
下記の一般式(II):
【化2】
で示される化合物を、カルボニルを含んでいる化合物と反応させる工程を含んでいる、構造1または2の化合物を作製する方法であって、
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、=N−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、CN、NO2、−N(R’)2、−C(O)R’、−C(O)N(R’)2、−OR’、および−S(O)kR’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R3およびR4はそれぞれ独立して、水素またはアミン保護基であり、
アミン保護基は、特に限定されないが、
【化3】
を包含している、方法。
【請求項16】
上記Aは結合である、請求項15に記載の方法。
【請求項17】
上記Bは結合である、請求項16に記載の方法。
【請求項18】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項15に記載の方法。
【請求項19】
上記R2は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項15に記載の方法。
【請求項20】
上記一般式(II)で示される化合物は、下記の一般式(IV):
【化4】
で示される構造を有し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、CN、NO2、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルである、請求項15に記載の方法。
【請求項21】
下記の一般式(V):
【化5】
で示される化合物とヒドラジンを含んでいる剤とを反応させる工程を含んでいる、構造3または4の化合物を作製する方法であって、
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−N(R’)CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、および−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Jは、
【化6】
であり、
Rは、H、アルキル、置換アルキル、シクロアルキル、または置換シクロアルキルであり;
R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキル、または保護基であるか、または2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成し;
R1は、H、アミノ保護基、樹脂、少なくとも1つのアミノ酸、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドであり;
R2は、OH、エステル保護基、樹脂、少なくとも1つのアミノ酸、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドであり;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
−A−B−J−R基は一緒になって、カルボニル基を包含するカルボニル基、保護されたカルボニル基を包含する保護されたカルボニル基、またはマスキングされたカルボニル基を包含するマスキングされたカルボニル基、を少なくとも1つ含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
−J−R基は一緒になって、カルボニル基を包含するカルボニル基、保護されたカルボニル基を包含する保護されたカルボニル基、またはマスキングされたカルボニル基を包含するマスキングされたカルボニル基、を少なくとも1つ含んでいる単環式または二環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項22】
下記の一般式(VI):
【化7】
に相当する、請求項21に記載の方法。
【請求項23】
下記の一般式(VII):
【化8】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1,2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、または置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項24】
下記の一般式(X):
【化9】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり、
YおよびZは独立して、−OH、アルキルで置換された酸素、−SHまたはアルキルで置換された硫黄から成る群より選択され、YおよびZは一緒になって、ヘテロシクロアルキル環を形成することができる、請求項21に記載の方法。
【請求項25】
下記の一般式(XI):
【化10】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、およびkは1、2または3である−S(O)kR’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Yは、独立して、OR’’、NR’’R’’、およびNC(O)R’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項26】
下記の一般式(XII):
【化11】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択される、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、2つ以上のRa基が存在する場合に、2つのRa基は必要に応じてシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4は独立して、H、ハロゲン、CN、NO2、アルキル、置換アルキル、N(R’)2、C(O)kR’、−C(O)N(R’)2、−OR’および−S(O)kR’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
XはC、NまたはSであり、ただしXがOまたはSである場合に、R4はH、ハロゲン、CN、NO2、アルキル、置換アルキル、N(R’)2、C(O)R’、−C(O)N(R’)2、−OR’およびkが1、2または3である−S(O)kR’ではあり得ず、nは0、1または2である、請求項21に記載の方法。
【請求項27】
下記の一般式(XIII):
【化12】
に相当し
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキルから成る群より選択され;
YおよびZは独立して、−OH、アルキルで置換された酸素、−SHおよびアルキルで置換された硫黄から成る群より選択され、YおよびZは一緒になって、シクロアルキル環を形成することができる、請求項21に記載の方法。
【請求項28】
下記の一般式(XIV):
【化13】
に相当し
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Bは、−CH=N−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−をさらに含み;
nは1、2または3であり;
Yは、独立して、OR’’、NR’’R’’およびNC(O)R’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項29】
上記化合物を、温和な条件下において水溶液中にてカルボニルを含んでいる剤と反応させる、請求項15に記載の方法。
【請求項30】
上記反応は、温和な条件下において水溶液中にて実施される、請求項21に記載の方法。
【請求項31】
下記化合物1、2、3または4の構造を有する剤またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を治療に効果的な量にて投与する工程を含んでいる、障害、疾病または病気を処置するための方法であって、
【化14】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、またはC(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項32】
薬学的に許容可能な担体を投与する工程をさらに含んでいる、請求項31に記載の方法。
【請求項33】
上記Xはポリアルキレンオキシドである、請求項31に記載の方法。
【請求項34】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項31に記載の方法。
【請求項35】
上記Xの少なくとも1つのアミノ酸は、非天然アミノ酸を含んでいる、請求項34に記載の方法。
【請求項36】
上記Xは検出可能な標識である、請求項31に記載の方法。
【請求項37】
下記の化合物5、6、7または8の構造を有する剤またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を治療に効果的な量にて投与する工程を含んでいる、障害、疾病または病気を処置するための方法であって、
【化15】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’およびS(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、または−C(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、およびC(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5基が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項38】
薬学的に許容可能な担体を投与する工程をさらに含んでいる、請求項37に記載の方法。
【請求項39】
上記R1およびR2の両方は、少なくとも1つのアミノ酸である、請求項37に記載の方法。
【請求項40】
上記Xはポリアルキレンオキシドである、請求項37に記載の方法。
【請求項41】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項37に記載の方法。
【請求項42】
患者中のポリペプチドの存在を検出するための方法であって、下記の化合物1〜4の構造を有する非天然アミノ酸またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を、少なくとも1つ含んでいる相同な非天然アミノ酸のポリペプチドを効果的な量にて投与する工程を含んでおり、
【化16】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nまたはmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルもしくは置換アルキルであるか;または、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、またはC(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5基が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項43】
上記ポリペプチドは、アルファ−1抗トリプシン、アンギオスタチン、抗溶血性因子、抗体、アポリポタンパク質、アポタンパク質、心房性ナトリウム利尿因子、心房性ナトリウム利尿ポリペプチド、心房性ペプチド、C−X−Cケモカイン、T39765、NAP−2、ENA−78、gro−a、gro−b、gro−c、IP−10、GCP−2、NAP−4、SDF−1、PF4、MIG、カルシトニン、c−kitリガンド、サイトカイン、CCケモカイン、単球走化性タンパク質−1、単球走化性タンパク質−2、単球走化性タンパク質−3、単球炎症性タンパク質−1アルファ、単球炎症性タンパク質−iベータ、ランテス、1309、R83915、R91733、HCC1、T58847、D31065、T64262、CD40、CD40リガンド、c−kitリガンド、コラーゲン、コロニー刺激因子(CSF)、補体因子5a、補体阻害剤、補体受容体1、サイトカイン、上皮性好中球活性化ペプチド−78、MIP−16、MCP−1、上皮成長因子(EGF)、上皮性好中球活性化ペプチド、エリトロポイエチン(EPO)、剥離性トキシン、ファクターIX、ファクターVII、ファクターVIII、ファクターX、線維芽細胞成長因子(FGF)、フィブリノゲン、フィブロネクチン、4−ヘリカルバンドルタンパク質、G−CSF、glp−1、GM−CSF、グルコセレブロシダーゼ、ゴナドトロピン、成長因子、成長因子受容体、grf、ヘッジホッグタンパク質、ヘモグロビン、肝細胞成長因子(hGF)、ヒルジン、ヒト成長ホルモン(hGH)、ヒト血清アルブミン、ICAM−1、ICAM−1受容体、LFA−1、LFA−1受容体、インシュリン、インシュリン様成長因子(IGF)、IGF−I、IGF−II、インターフェロン(IFN)、IFN−アルファ、IFN−ベータ、IFN−ガンマ、インターロイキン(IL)、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−11、IL−12、ケラチノサイト成長因子(KGF)、ラクトフェリン、白血病抑制因子、ルシフェラーゼ、ニュールチュリン、好中球阻害因子(NIF)、オンコスタチンM、骨形成タンパク質、癌遺伝子産物、パラシトニン、副甲状腺ホルモン、PD−ECSF、PDGF、ペプチドホルモン、プレイオトロピン、プロテインA、プロテインG、pth、発熱性外毒素A、発熱性外毒素B、発熱性外毒素C、pyy、レラキシン、レニン、SCF、生合成された低分子タンパク質、可溶性補体受容体I、可溶性I−CAM1、可溶性インターロイキン受容体、可溶性TNF受容体、ソマトメジン、ソマトスタチン、ソマトトロピン、ストレプトキナーゼ、超抗原、ブドウ球菌のエンテロトキシン、SEA、SEB、SEC1、SEC2、SEC3、SED、SEE、ステロイドホルモン受容体、スーパーオキシドジスムターゼ、毒素性ショック症候群毒素、チモシンアルファ1、組織プラスミノゲン活性化因子、腫瘍成長因子(TGF)、腫瘍壊死因子、腫瘍壊死因子アルファ、腫瘍壊死因子ベータ、腫瘍壊死因子受容体(TNFR)、VLA−4タンパク質、VCAM−1タンパク質、血管内皮成長因子(VEGF)、ウロキナーゼ、mos、ras、raf、met、p53、tat、fos、myc、jun、myb、rel、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体、テストステロン受容体、アルドステロン受容体、LDL受容体、およびコルチコステロンから成る群より選択される治療タンパク質に相同なタンパク質である、請求項42に記載の方法。
【請求項1】
下記の化合物1〜4の構造を有し:
【化1】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は、必要に応じてシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、または−C(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤;少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され;
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する化合物、またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグ、もしくは溶媒和物。
【請求項2】
上記Aは、結合、置換もしくは非置換の低級アルキレン、またはフェニレン、ピリジニレン、ピリミジニレンおよびチオフェニレンから成る群より選択される非置換もしくは置換のアリーレンである、請求項1に記載の化合物。
【請求項3】
上記Aは結合である、請求項2に記載の化合物。
【請求項4】
上記Bは、結合、低級アルキレン、置換低級アルキレン、−O−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−CON(R’’)−、−NR’−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−N(R’’)CO−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−CON(R’’)−(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−S(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、−S(O)(アルキレンもしくは置換アルキレン)−、または−S(O)2(アルキレンもしくは置換アルキレン)−である、請求項1に記載の化合物。
【請求項5】
上記Bは結合である、請求項5に記載の化合物。
【請求項6】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項7】
上記R2は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項8】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項7に記載の化合物。
【請求項9】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項1に記載の化合物。
【請求項10】
上記Xは、蛍光性部分、燐光性部分、化学発光性部分、キレート化部分、電子密度の高い部分、磁性部分、インターカレートする部分、放射性部分、発色性部分、およびエネルギーを伝達する部分から成る群より選択される検出可能な標識である、請求項1に記載の化合物。
【請求項11】
上記Xは水溶性ポリマーである、請求項1に記載の化合物。
【請求項12】
上記水溶性ポリマーは、ポリアルキレンオキシドまたは置換ポリアルキレンオキシドを含んでいる、請求項11に記載の化合物。
【請求項13】
上記水溶性ポリマーは、−[(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−(水素、アルキルまたは置換アルキル)]xを含んでおり、xは20〜10,000である、請求項11に記載の化合物。
【請求項14】
上記水溶性ポリマーは、約2KDa〜約40KDaの分子量を有するm−PEGである、請求項11に記載の化合物。
【請求項15】
下記の一般式(II):
【化2】
で示される化合物を、カルボニルを含んでいる化合物と反応させる工程を含んでいる、構造1または2の化合物を作製する方法であって、
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、=N−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、CN、NO2、−N(R’)2、−C(O)R’、−C(O)N(R’)2、−OR’、および−S(O)kR’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R3およびR4はそれぞれ独立して、水素またはアミン保護基であり、
アミン保護基は、特に限定されないが、
【化3】
を包含している、方法。
【請求項16】
上記Aは結合である、請求項15に記載の方法。
【請求項17】
上記Bは結合である、請求項16に記載の方法。
【請求項18】
上記R1は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項15に記載の方法。
【請求項19】
上記R2は少なくとも1つのアミノ酸である、請求項15に記載の方法。
【請求項20】
上記一般式(II)で示される化合物は、下記の一般式(IV):
【化4】
で示される構造を有し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、CN、NO2、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルである、請求項15に記載の方法。
【請求項21】
下記の一般式(V):
【化5】
で示される化合物とヒドラジンを含んでいる剤とを反応させる工程を含んでいる、構造3または4の化合物を作製する方法であって、
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−N(R’)CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、および−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Jは、
【化6】
であり、
Rは、H、アルキル、置換アルキル、シクロアルキル、または置換シクロアルキルであり;
R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキル、または保護基であるか、または2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成し;
R1は、H、アミノ保護基、樹脂、少なくとも1つのアミノ酸、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドであり;
R2は、OH、エステル保護基、樹脂、少なくとも1つのアミノ酸、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドであり;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
−A−B−J−R基は一緒になって、カルボニル基を包含するカルボニル基、保護されたカルボニル基を包含する保護されたカルボニル基、またはマスキングされたカルボニル基を包含するマスキングされたカルボニル基、を少なくとも1つ含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
−J−R基は一緒になって、カルボニル基を包含するカルボニル基、保護されたカルボニル基を包含する保護されたカルボニル基、またはマスキングされたカルボニル基を包含するマスキングされたカルボニル基、を少なくとも1つ含んでいる単環式または二環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項22】
下記の一般式(VI):
【化7】
に相当する、請求項21に記載の方法。
【請求項23】
下記の一般式(VII):
【化8】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1,2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、または置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項24】
下記の一般式(X):
【化9】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり、
YおよびZは独立して、−OH、アルキルで置換された酸素、−SHまたはアルキルで置換された硫黄から成る群より選択され、YおよびZは一緒になって、ヘテロシクロアルキル環を形成することができる、請求項21に記載の方法。
【請求項25】
下記の一般式(XI):
【化10】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、およびkは1、2または3である−S(O)kR’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Yは、独立して、OR’’、NR’’R’’、およびNC(O)R’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項26】
下記の一般式(XII):
【化11】
に相当し、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択される、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、2つ以上のRa基が存在する場合に、2つのRa基は必要に応じてシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4は独立して、H、ハロゲン、CN、NO2、アルキル、置換アルキル、N(R’)2、C(O)kR’、−C(O)N(R’)2、−OR’および−S(O)kR’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
XはC、NまたはSであり、ただしXがOまたはSである場合に、R4はH、ハロゲン、CN、NO2、アルキル、置換アルキル、N(R’)2、C(O)R’、−C(O)N(R’)2、−OR’およびkが1、2または3である−S(O)kR’ではあり得ず、nは0、1または2である、請求項21に記載の方法。
【請求項27】
下記の一般式(XIII):
【化12】
に相当し
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキルから成る群より選択され;
YおよびZは独立して、−OH、アルキルで置換された酸素、−SHおよびアルキルで置換された硫黄から成る群より選択され、YおよびZは一緒になって、シクロアルキル環を形成することができる、請求項21に記載の方法。
【請求項28】
下記の一般式(XIV):
【化13】
に相当し
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’、および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
Bは、−CH=N−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−をさらに含み;
nは1、2または3であり;
Yは、独立して、OR’’、NR’’R’’およびNC(O)R’’から成る群より選択され、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキル、置換アルキルである、請求項21に記載の方法。
【請求項29】
上記化合物を、温和な条件下において水溶液中にてカルボニルを含んでいる剤と反応させる、請求項15に記載の方法。
【請求項30】
上記反応は、温和な条件下において水溶液中にて実施される、請求項21に記載の方法。
【請求項31】
下記化合物1、2、3または4の構造を有する剤またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を治療に効果的な量にて投与する工程を含んでいる、障害、疾病または病気を処置するための方法であって、
【化14】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、またはC(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項32】
薬学的に許容可能な担体を投与する工程をさらに含んでいる、請求項31に記載の方法。
【請求項33】
上記Xはポリアルキレンオキシドである、請求項31に記載の方法。
【請求項34】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項31に記載の方法。
【請求項35】
上記Xの少なくとも1つのアミノ酸は、非天然アミノ酸を含んでいる、請求項34に記載の方法。
【請求項36】
上記Xは検出可能な標識である、請求項31に記載の方法。
【請求項37】
下記の化合物5、6、7または8の構造を有する剤またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を治療に効果的な量にて投与する工程を含んでいる、障害、疾病または病気を処置するための方法であって、
【化15】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、−アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nおよびmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’およびS(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであるか;あるいは、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、または−C(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは、
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、およびC(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5基が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項38】
薬学的に許容可能な担体を投与する工程をさらに含んでいる、請求項37に記載の方法。
【請求項39】
上記R1およびR2の両方は、少なくとも1つのアミノ酸である、請求項37に記載の方法。
【請求項40】
上記Xはポリアルキレンオキシドである、請求項37に記載の方法。
【請求項41】
上記Xは少なくとも1つのアミノ酸である、請求項37に記載の方法。
【請求項42】
患者中のポリペプチドの存在を検出するための方法であって、下記の化合物1〜4の構造を有する非天然アミノ酸またはその活性のある代謝産物、塩、薬学的に許容可能なプロドラッグもしくは溶媒和物を、少なくとも1つ含んでいる相同な非天然アミノ酸のポリペプチドを効果的な量にて投与する工程を含んでおり、
【化16】
Aは必要に応じて存在し、存在する場合に、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級シクロアルキレン、置換低級シクロアルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、アルキニレン、置換アルキニレン、低級ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、低級ヘテロシクロアルキレン、置換低級ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、アルカリレン、置換アルカリレン、アラルキレン、または置換アラルキレンであり;
Bは必要に応じて存在し、存在する場合に、一方の末端においてインドールを含んでいる部分と連結しているリンカーであり、
該リンカーは、低級アルキレン、置換低級アルキレン、低級アルケニレン、置換低級アルケニレン、低級ヘテロアルキレン、置換低級ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、置換ヘテロアリーレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−NS(O)2−、−OS(O)2−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)C(NCN)N(R’)−、−N(R’)C(NNO2)N(R’)−、−N(R’)C(NCOOR’)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
R1は、H、アミノ保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
R2は、OH、エステル保護基、または少なくとも1つのアミノ酸であり;
nは0、1、2または3であり、mは0、1、2または3であり、nまたはmの少なくとも1つは0ではなく;
Ra基に結合される構造1、2、3および4のそれぞれの環は、0、1つまたは2つのRa基を含んでいることができ、
Raはそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、−N(R’’)2、−C(O)R’’、−C(O)N(R’’)2、−OR’’および−S(O)kR’’から成る群より選択され、kは1、2または3であり、R’’はそれぞれ独立して、H、アルキルもしくは置換アルキルであるか;または、
2つ以上のRa基が存在するときに、2つのRaは必要に応じて、アリール、シクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成し;
R3およびR4はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、低級アルキルもしくは置換低級アルキルであるか、またはR3基およびR4基もしくは2つのR3基は必要に応じて、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを形成し;
R5はそれぞれ独立して、H、ハロゲン、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アルキルアルコキシ、置換アルキルアルコキシ、ポリアルキレンオキシド、置換ポリアルキレンオキシド、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、置換アラルキル、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−ON(R’’)2、OH、NH2、CN、NO2、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)SR’’、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−(アリールまたは置換アリール)、−C(O)R’’、−C(O)2R’’、またはC(O)N(R’’)2であり、
R’’はそれぞれ独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルコキシ、置換アルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、アルカリル、置換アルカリル、アラルキル、もしくは置換アラルキルであるか、または、
2つ以上のR’’基が存在するときに、2つのR’’は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルを形成するか;あるいは
R5はL−Xであり、
Xは、水溶性ポリマー;ポリアルキレンオキシド;ポリエチレングリコール;ポリエチレングリコールの誘導体;光架橋剤:少なくとも1つのアミノ酸;少なくとも1つの糖類;少なくとも1つのヌクレオチド;少なくとも1つのヌクレオシド;リガンド;ビオチン;ビオチンの類似体;検出可能な標識;およびこれらの任意の組合せから成る群より選択され、
Lは必要に応じて存在し、存在する場合に、アルキレン、置換アルキレン、アルケニレン、置換アルケニレン、−O−、−O−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S−、−S−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−S(O)k−、−S(O)k(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)−、−C(O)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(S)−、−C(S)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)−、−NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−C(O)N(R’)−、−CON(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−CSN(R’)−、−CSN(R’)−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)CO−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−N(R’)C(O)O−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−O−N=CR’−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−C(O)NR’−(アルキレンまたは置換アルキレン)−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S(O)k−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−、−(アルキレンまたは置換アルキレン)−S−S−、−S(O)kN(R’)−、−N(R’)C(O)N(R’)−、−N(R’)C(S)N(R’)−、−N(R’)S(O)kN(R’)−、−N(R’)−N=、−C(R’)=N−、−C(R’)=N−N(R’)−、−C(R’)=N−N=、−C(R’)2−N=N−、および−C(R’)2−N(R’)−N(R’)−から成る群より選択されるリンカーであり、kは1、2または3であり、R’はそれぞれ独立して、H、アルキルまたは置換アルキルであり;
2つ以上のR5基が存在するときに、2つのオルトR5基は必要に応じて、ヘテロシクロアルキルまたは芳香族ヘテロシクロアルキルを形成することができるか;あるいは、
−B−インドールを含んでいる部分は一緒になって、少なくとも1つのインドール部分を含んでいる二環式または三環式のシクロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルを形成する、方法。
【請求項43】
上記ポリペプチドは、アルファ−1抗トリプシン、アンギオスタチン、抗溶血性因子、抗体、アポリポタンパク質、アポタンパク質、心房性ナトリウム利尿因子、心房性ナトリウム利尿ポリペプチド、心房性ペプチド、C−X−Cケモカイン、T39765、NAP−2、ENA−78、gro−a、gro−b、gro−c、IP−10、GCP−2、NAP−4、SDF−1、PF4、MIG、カルシトニン、c−kitリガンド、サイトカイン、CCケモカイン、単球走化性タンパク質−1、単球走化性タンパク質−2、単球走化性タンパク質−3、単球炎症性タンパク質−1アルファ、単球炎症性タンパク質−iベータ、ランテス、1309、R83915、R91733、HCC1、T58847、D31065、T64262、CD40、CD40リガンド、c−kitリガンド、コラーゲン、コロニー刺激因子(CSF)、補体因子5a、補体阻害剤、補体受容体1、サイトカイン、上皮性好中球活性化ペプチド−78、MIP−16、MCP−1、上皮成長因子(EGF)、上皮性好中球活性化ペプチド、エリトロポイエチン(EPO)、剥離性トキシン、ファクターIX、ファクターVII、ファクターVIII、ファクターX、線維芽細胞成長因子(FGF)、フィブリノゲン、フィブロネクチン、4−ヘリカルバンドルタンパク質、G−CSF、glp−1、GM−CSF、グルコセレブロシダーゼ、ゴナドトロピン、成長因子、成長因子受容体、grf、ヘッジホッグタンパク質、ヘモグロビン、肝細胞成長因子(hGF)、ヒルジン、ヒト成長ホルモン(hGH)、ヒト血清アルブミン、ICAM−1、ICAM−1受容体、LFA−1、LFA−1受容体、インシュリン、インシュリン様成長因子(IGF)、IGF−I、IGF−II、インターフェロン(IFN)、IFN−アルファ、IFN−ベータ、IFN−ガンマ、インターロイキン(IL)、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−11、IL−12、ケラチノサイト成長因子(KGF)、ラクトフェリン、白血病抑制因子、ルシフェラーゼ、ニュールチュリン、好中球阻害因子(NIF)、オンコスタチンM、骨形成タンパク質、癌遺伝子産物、パラシトニン、副甲状腺ホルモン、PD−ECSF、PDGF、ペプチドホルモン、プレイオトロピン、プロテインA、プロテインG、pth、発熱性外毒素A、発熱性外毒素B、発熱性外毒素C、pyy、レラキシン、レニン、SCF、生合成された低分子タンパク質、可溶性補体受容体I、可溶性I−CAM1、可溶性インターロイキン受容体、可溶性TNF受容体、ソマトメジン、ソマトスタチン、ソマトトロピン、ストレプトキナーゼ、超抗原、ブドウ球菌のエンテロトキシン、SEA、SEB、SEC1、SEC2、SEC3、SED、SEE、ステロイドホルモン受容体、スーパーオキシドジスムターゼ、毒素性ショック症候群毒素、チモシンアルファ1、組織プラスミノゲン活性化因子、腫瘍成長因子(TGF)、腫瘍壊死因子、腫瘍壊死因子アルファ、腫瘍壊死因子ベータ、腫瘍壊死因子受容体(TNFR)、VLA−4タンパク質、VCAM−1タンパク質、血管内皮成長因子(VEGF)、ウロキナーゼ、mos、ras、raf、met、p53、tat、fos、myc、jun、myb、rel、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体、テストステロン受容体、アルドステロン受容体、LDL受容体、およびコルチコステロンから成る群より選択される治療タンパク質に相同なタンパク質である、請求項42に記載の方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【公表番号】特表2010−512800(P2010−512800A)
【公表日】平成22年4月30日(2010.4.30)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2009−543156(P2009−543156)
【出願日】平成19年12月18日(2007.12.18)
【国際出願番号】PCT/US2007/088011
【国際公開番号】WO2008/077079
【国際公開日】平成20年6月26日(2008.6.26)
【出願人】(508048481)アンブルックス,インコーポレイテッド (22)
【氏名又は名称原語表記】Ambrx,Inc.
【住所又は居所原語表記】10975 North Torrey Pines Road,Suite 100,La Jolla,California 92037,United States of America
【Fターム(参考)】
【公表日】平成22年4月30日(2010.4.30)
【国際特許分類】
【出願日】平成19年12月18日(2007.12.18)
【国際出願番号】PCT/US2007/088011
【国際公開番号】WO2008/077079
【国際公開日】平成20年6月26日(2008.6.26)
【出願人】(508048481)アンブルックス,インコーポレイテッド (22)
【氏名又は名称原語表記】Ambrx,Inc.
【住所又は居所原語表記】10975 North Torrey Pines Road,Suite 100,La Jolla,California 92037,United States of America
【Fターム(参考)】
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